MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 20909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017253	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017253	TAA	3	9	29	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017253	ATT	3	9	43	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017253	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017253	T	7	7	57	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017253	T	7	7	65	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017253	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017253	T	8	8	103	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017253	TTTAA	2	10	204	213	40 %	60 %	0 %	0 %	414562367
10	NC_017253	GTT	2	6	231	236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
11	NC_017253	AGC	2	6	260	265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562367
12	NC_017253	TCA	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
13	NC_017253	ATT	2	6	296	301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
14	NC_017253	CTCA	2	8	303	310	25 %	25 %	0 %	50 %	414562367
15	NC_017253	A	6	6	310	315	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
16	NC_017253	GGT	2	6	399	404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562367
17	NC_017253	ATG	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562367
18	NC_017253	CTG	2	6	469	474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562367
19	NC_017253	CTA	2	6	481	486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
20	NC_017253	A	8	8	524	531	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
21	NC_017253	A	6	6	536	541	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
22	NC_017253	AAT	2	6	546	551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562367
23	NC_017253	TGT	2	6	602	607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
24	NC_017253	GT	3	6	610	615	0 %	50 %	50 %	0 %	414562367
25	NC_017253	AATT	2	8	629	636	50 %	50 %	0 %	0 %	414562367
26	NC_017253	AGC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562367
27	NC_017253	T	6	6	671	676	0 %	100 %	0 %	0 %	414562367
28	NC_017253	AGG	2	6	677	682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414562367
29	NC_017253	CTG	2	6	712	717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562367
30	NC_017253	CGC	2	6	802	807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	414562367
31	NC_017253	TTA	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
32	NC_017253	T	6	6	877	882	0 %	100 %	0 %	0 %	414562367
33	NC_017253	CAT	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
34	NC_017253	CA	3	6	932	937	50 %	0 %	0 %	50 %	414562367
35	NC_017253	A	6	6	946	951	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
36	NC_017253	ATA	2	6	960	965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562367
37	NC_017253	AT	3	6	990	995	50 %	50 %	0 %	0 %	414562367
38	NC_017253	T	6	6	1001	1006	0 %	100 %	0 %	0 %	414562367
39	NC_017253	TAG	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562367
40	NC_017253	T	7	7	1238	1244	0 %	100 %	0 %	0 %	414562367
41	NC_017253	ATTA	2	8	1280	1287	50 %	50 %	0 %	0 %	414562367
42	NC_017253	T	6	6	1296	1301	0 %	100 %	0 %	0 %	414562367
43	NC_017253	ACT	2	6	1320	1325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
44	NC_017253	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562367
45	NC_017253	TTG	2	6	1353	1358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
46	NC_017253	GCA	2	6	1371	1376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414562367
47	NC_017253	GAT	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562367
48	NC_017253	ACT	2	6	1452	1457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
49	NC_017253	CTTT	2	8	1509	1516	0 %	75 %	0 %	25 %	414562367
50	NC_017253	AGA	2	6	1520	1525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562367
51	NC_017253	A	9	9	1640	1648	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
52	NC_017253	A	7	7	1685	1691	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
53	NC_017253	TA	3	6	1693	1698	50 %	50 %	0 %	0 %	414562367
54	NC_017253	TTAAT	2	10	1702	1711	40 %	60 %	0 %	0 %	414562367
55	NC_017253	TTA	2	6	1734	1739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
56	NC_017253	TTG	2	6	1798	1803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
57	NC_017253	AGA	2	6	1868	1873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562367
58	NC_017253	A	6	6	1889	1894	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
59	NC_017253	ATC	2	6	1910	1915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562367
60	NC_017253	TCT	2	6	1947	1952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562367
61	NC_017253	GTT	2	6	1956	1961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562367
62	NC_017253	A	6	6	1962	1967	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
63	NC_017253	GCT	2	6	2028	2033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562367
64	NC_017253	TTA	2	6	2043	2048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562367
65	NC_017253	A	7	7	2057	2063	100 %	0 %	0 %	0 %	414562367
66	NC_017253	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017253	T	6	6	2123	2128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017253	AAAATT	2	12	2139	2150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017253	ATA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017253	T	8	8	2230	2237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017253	T	6	6	2249	2254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017253	GA	3	6	2271	2276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017253	AT	3	6	2314	2319	50 %	50 %	0 %	0 %	414562368
74	NC_017253	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562368
75	NC_017253	AGAT	2	8	2343	2350	50 %	25 %	25 %	0 %	414562368
76	NC_017253	ATT	2	6	2366	2371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562368
77	NC_017253	TCT	2	6	2387	2392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562368
78	NC_017253	ATT	2	6	2394	2399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562368
79	NC_017253	T	7	7	2423	2429	0 %	100 %	0 %	0 %	414562368
80	NC_017253	T	9	9	2446	2454	0 %	100 %	0 %	0 %	414562368
81	NC_017253	T	6	6	2460	2465	0 %	100 %	0 %	0 %	414562368
82	NC_017253	A	8	8	2476	2483	100 %	0 %	0 %	0 %	414562368
83	NC_017253	TATT	2	8	2607	2614	25 %	75 %	0 %	0 %	414562368
84	NC_017253	T	7	7	2619	2625	0 %	100 %	0 %	0 %	414562368
85	NC_017253	GATT	2	8	2650	2657	25 %	50 %	25 %	0 %	414562368
86	NC_017253	ATTT	2	8	2665	2672	25 %	75 %	0 %	0 %	414562368
87	NC_017253	CTG	2	6	2715	2720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562368
88	NC_017253	ATATTA	2	12	2721	2732	50 %	50 %	0 %	0 %	414562368
89	NC_017253	T	8	8	2756	2763	0 %	100 %	0 %	0 %	414562368
90	NC_017253	ATTTT	2	10	2765	2774	20 %	80 %	0 %	0 %	414562368
91	NC_017253	ATT	2	6	2914	2919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562368
92	NC_017253	TTTTA	2	10	2947	2956	20 %	80 %	0 %	0 %	414562368
93	NC_017253	TGC	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414562368
94	NC_017253	TGG	2	6	2975	2980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562368
95	NC_017253	T	6	6	2989	2994	0 %	100 %	0 %	0 %	414562368
96	NC_017253	TAA	2	6	3024	3029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562368
97	NC_017253	TTTTAT	2	12	3043	3054	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	414562368
98	NC_017253	T	7	7	3119	3125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017253	TA	3	6	3170	3175	50 %	50 %	0 %	0 %	414562369
100	NC_017253	TGG	2	6	3189	3194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414562369
101	NC_017253	GGAATT	2	12	3221	3232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562369
102	NC_017253	ATT	2	6	3283	3288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562369
103	NC_017253	T	6	6	3299	3304	0 %	100 %	0 %	0 %	414562369
104	NC_017253	TA	3	6	3357	3362	50 %	50 %	0 %	0 %	414562369
105	NC_017253	T	7	7	3383	3389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017253	T	6	6	3397	3402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017253	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017253	ATT	2	6	3414	3419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017253	ATT	2	6	3424	3429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017253	T	7	7	3446	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017253	AT	3	6	3569	3574	50 %	50 %	0 %	0 %	414562370
112	NC_017253	CCT	2	6	3579	3584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414562370
113	NC_017253	ATT	2	6	3585	3590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562370
114	NC_017253	A	7	7	3641	3647	100 %	0 %	0 %	0 %	414562370
115	NC_017253	TA	3	6	3661	3666	50 %	50 %	0 %	0 %	414562370
116	NC_017253	A	9	9	3673	3681	100 %	0 %	0 %	0 %	414562370
117	NC_017253	ATT	2	6	3693	3698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562370
118	NC_017253	AGA	2	6	3761	3766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562370
119	NC_017253	AGA	2	6	3785	3790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414562370
120	NC_017253	A	7	7	3795	3801	100 %	0 %	0 %	0 %	414562370
121	NC_017253	AGT	2	6	3869	3874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562370
122	NC_017253	A	6	6	3898	3903	100 %	0 %	0 %	0 %	414562370
123	NC_017253	A	8	8	3909	3916	100 %	0 %	0 %	0 %	414562370
124	NC_017253	GAT	2	6	3927	3932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562370
125	NC_017253	GTT	2	6	3941	3946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414562370
126	NC_017253	CTT	2	6	3961	3966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562370
127	NC_017253	AAT	2	6	4049	4054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
128	NC_017253	AT	3	6	4074	4079	50 %	50 %	0 %	0 %	414562371
129	NC_017253	TTA	2	6	4086	4091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562371
130	NC_017253	A	6	6	4109	4114	100 %	0 %	0 %	0 %	414562371
131	NC_017253	T	6	6	4123	4128	0 %	100 %	0 %	0 %	414562371
132	NC_017253	TGA	2	6	4192	4197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562371
133	NC_017253	A	6	6	4204	4209	100 %	0 %	0 %	0 %	414562371
134	NC_017253	TAA	2	6	4212	4217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
135	NC_017253	ATT	2	6	4219	4224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562371
136	NC_017253	AT	3	6	4245	4250	50 %	50 %	0 %	0 %	414562371
137	NC_017253	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
138	NC_017253	CAT	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562371
139	NC_017253	TTC	2	6	4379	4384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414562371
140	NC_017253	A	8	8	4387	4394	100 %	0 %	0 %	0 %	414562371
141	NC_017253	TA	4	8	4402	4409	50 %	50 %	0 %	0 %	414562371
142	NC_017253	AAT	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562371
143	NC_017253	ATC	2	6	4482	4487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414562371
144	NC_017253	AAT	3	9	4523	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017253	AT	3	6	4530	4535	50 %	50 %	0 %	0 %	414562372
146	NC_017253	ATTA	2	8	4563	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	414562372
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149	NC_017253	TAT	2	6	4623	4628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414562372
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151	NC_017253	TAA	2	6	4701	4706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414562372
152	NC_017253	T	6	6	4839	4844	0 %	100 %	0 %	0 %	414562372
153	NC_017253	AGT	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414562372
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156	NC_017253	AATT	2	8	5027	5034	50 %	50 %	0 %	0 %	414562372
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194	NC_017253	TAA	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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